Python Module Index

b
 
b
bionetgen
    bionetgen.atomizer
    bionetgen.atomizer.atomizer
    bionetgen.atomizer.atomizer.analyzeSBML
    bionetgen.atomizer.atomizer.atomizationAux
    bionetgen.atomizer.atomizer.atomizerUtils
    bionetgen.atomizer.atomizer.detectOntology
    bionetgen.atomizer.atomizer.moleculeCreation
    bionetgen.atomizer.atomizer.resolveSCT
    bionetgen.atomizer.atomizeTool
    bionetgen.atomizer.bngModel
    bionetgen.atomizer.libsbml2bngl
    bionetgen.atomizer.merging
    bionetgen.atomizer.rulifier
    bionetgen.atomizer.rulifier.arial10
    bionetgen.atomizer.rulifier.componentGroups
    bionetgen.atomizer.rulifier.postAnalysis
    bionetgen.atomizer.sbml2bngl
    bionetgen.atomizer.sbml2json
    bionetgen.atomizer.utils
    bionetgen.atomizer.utils.consoleCommands
    bionetgen.atomizer.utils.extractAtomic
    bionetgen.atomizer.utils.pathwaycommons
    bionetgen.atomizer.utils.readBNGXML
    bionetgen.atomizer.utils.smallStructures
    bionetgen.atomizer.utils.structures
    bionetgen.atomizer.utils.util
    bionetgen.atomizer.writer
    bionetgen.atomizer.writer.bnglWriter
    bionetgen.core
    bionetgen.core.defaults
    bionetgen.core.exc
    bionetgen.core.main
    bionetgen.core.notebook
    bionetgen.core.version
    bionetgen.main
    bionetgen.modelapi
    bionetgen.modelapi.blocks
    bionetgen.modelapi.bngfile
    bionetgen.modelapi.bngparser
    bionetgen.modelapi.model
    bionetgen.modelapi.pattern
    bionetgen.modelapi.runner
    bionetgen.modelapi.structs
    bionetgen.modelapi.utils
    bionetgen.modelapi.xmlparsers
    bionetgen.simulator
    bionetgen.simulator.simulators
    bionetgen.tools
    bionetgen.tools.cli
    bionetgen.tools.gdiff
    bionetgen.tools.info
    bionetgen.tools.plot
    bionetgen.tools.result
    bionetgen.tools.visualize