Contents:
bionetgen
bionetgen.atomizer
bionetgen.atomizer.atomizer
bionetgen.atomizer.atomizer.analyzeSBML
bionetgen.atomizer.atomizer.atomizationAux
bionetgen.atomizer.atomizer.atomizerUtils
bionetgen.atomizer.atomizer.detectOntology
bionetgen.atomizer.atomizer.moleculeCreation
bionetgen.atomizer.atomizer.resolveSCT
bionetgen.atomizer.atomizeTool
bionetgen.atomizer.biogrid
bionetgen.atomizer.bngModel
bionetgen.atomizer.libsbml2bngl
bionetgen.atomizer.merging
bionetgen.atomizer.parseAnnotation
bionetgen.atomizer.rulifier
bionetgen.atomizer.rulifier.arial10
bionetgen.atomizer.rulifier.componentGroups
bionetgen.atomizer.rulifier.postAnalysis
bionetgen.atomizer.sbml2bngl
bionetgen.atomizer.sbml2json
bionetgen.atomizer.utils
bionetgen.atomizer.utils.consoleCommands
bionetgen.atomizer.utils.extractAtomic
bionetgen.atomizer.utils.pathwaycommons
bionetgen.atomizer.utils.readBNGXML
bionetgen.atomizer.utils.smallStructures
bionetgen.atomizer.utils.structures
bionetgen.atomizer.utils.util
bionetgen.atomizer.writer
bionetgen.atomizer.writer.bnglWriter
bionetgen.core
bionetgen.core.defaults
bionetgen.core.exc
bionetgen.core.main
bionetgen.core.notebook
bionetgen.core.tools
bionetgen.core.tools.cli
bionetgen.core.tools.gdiff
bionetgen.core.tools.info
bionetgen.core.tools.plot
bionetgen.core.tools.result
bionetgen.core.tools.visualize
bionetgen.core.utils
bionetgen.core.utils.logging
bionetgen.core.utils.utils
bionetgen.core.version
bionetgen.main
bionetgen.modelapi
bionetgen.modelapi.blocks
bionetgen.modelapi.bngfile
bionetgen.modelapi.bngparser
bionetgen.modelapi.model
bionetgen.modelapi.pattern
bionetgen.modelapi.pattern_reader
bionetgen.modelapi.rulemod
bionetgen.modelapi.runner
bionetgen.modelapi.structs
bionetgen.modelapi.xmlparsers
bionetgen.network
bionetgen.network.blocks
bionetgen.network.network
bionetgen.network.networkparser
bionetgen.network.structs
bionetgen.simulator
bionetgen.simulator.bngsimulator
bionetgen.simulator.csimulator
bionetgen.simulator.librrsimulator
bionetgen.simulator.simulators